Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB15Q9Y5E8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB15Q9Y5E8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms