Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms