Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms