Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPATCH8Q9UKJ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPATCH8Q9UKJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms