Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms