Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms