Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms