Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms