Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms