Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms