Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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