Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRBP1Q9P2E9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms