Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms