Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms