Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms