Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms