Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms