Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms