Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms