Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms