Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDEM3Q9BZQ6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms