Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms