Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPOQ9BU64 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPOQ9BU64 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms