Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPPED1Q9BRF8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPPED1Q9BRF8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPPED1Q9BRF8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPPED1Q9BRF8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPPED1Q9BRF8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms