Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms