Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms