Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRNP1Q96S65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms