Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAM1Q96QH2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAM1Q96QH2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms