Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms