Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP3Q96P20 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms