Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms