Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms