Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms