Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms