Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms