Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms