Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms