Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC97Q96F63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC97Q96F63 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms