Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms