Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms