Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms