Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms