Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUAP1Q96AJ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUAP1Q96AJ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms