Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms