Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms