Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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