Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00116Q8NCU8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms