Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms