Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SMIM20Q8N5G0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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