Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms